O CTNEN atende aos munícipes de São Caetano do Sul, sendo responsável pela coleta do Teste do Pezinho visando detectar e tratar as doenças genéticas ou congênitas (anemia falciforme, hipotireoidismo congênito, fibrose cística e fenilcetonúria). Além disso, trabalha-se a estimulação neurossensorial para bebês prematuros, de baixo peso ou de risco para o desenvolvimento.